home *** CD-ROM | disk | FTP | other *** search
/ BCI NET 2 / BCI NET 2.iso / archives / demos / misc / prosite.lha / Prosite / data / PDOC00583 < prev    next >
Encoding:
Text File  |  1995-03-04  |  1.3 KB  |  28 lines
  1. **********************************************************
  2. * Electron transfer flavoprotein alpha-subunit signature *
  3. **********************************************************
  4.  
  5. The electron  transfer flavoprotein (ETF) [1] serves  as  a  specific electron
  6. acceptor for various mitochondrial dehydrogenases.  ETF transfers electrons to
  7. the  main  respiratory chain  via  ETF-ubiquinone  oxidoreductase.  ETF  is an
  8. heterodimer that consist of  an  alpha  and  a beta-subunit and which bind one
  9. molecule of FAD per dimer.
  10.  
  11. The alpha subunit of ETF  is a  protein of  about  32 Kd which is structurally
  12. related to the bacterial nitrogen fixation protein fixB [2] which could play a
  13. role in a redox process.
  14.  
  15. As  a signature  pattern  for these  proteins  we  selected a highly conserved
  16. region which is located in the C-terminal section.
  17.  
  18. -Consensus pattern: D-x-Q-[LIVM]-G-Q-T-G-x(4)-P-x-L-Y-I-A-x-G-I-S-G-A-[LIVM]-
  19.                     Q-H
  20. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  21. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  22. -Last update: December 1992 / First entry.
  23.  
  24. [ 1] Finocchiaro G., Ikeda Y., Ito M., Tanaka K.
  25.      Prog. Clin. Biol. Res. 321:637-652(1990).
  26. [ 2] Arigoni F., Kaminski P.A., Hennecke H., Elmerich C.
  27.      Mol. Gen. Genet. 225:514-520(1991).
  28.